上海－纽约国际联合语言学院是外语学院下属的合作办学项目，采用上海理工大学中外合作办学的独特管理体制：理事会领导下的院长负责制。理事会由中美双方有关人员组成，理事长由中方校长担任，副理事长由美方校长担任；由理事会任命中外双方院长和相关负责人，共同参与管理，对理事会负责。在办学经费投入上，双方以不同形式投入。中方着重投入教学设施、设备、改善教学环境；美方主要是智力支持，负责选派教师、提供课程及教材信息，另外负担部分美方教师的国际旅费，提供优秀毕业生的奖学金。

上海－纽约国际联合语言学院和学校其他国际合作项目一样，在教学管理上具有较大的运行空间和灵活性，其中包括教师资源的利用、教学资源的分配、课程时间的安排等。中方教师的管理和语言类课程的管理主要进入外语学院英语专业教学管理体系，美方教师的管理和项目中由美方教师教授的经济贸易类课程由美方负责人和中方负责人共同管理。中美双方管理人员互相配合、互相监督、互相学习，形成了和谐高效的管理机制。2005年中美项目负责人共同撰文（In Ilan Alon and John R. McIntyre (Eds.), Business and Management Education in China, World Scientific, Fall, 2005），以项目为例，总结了合作项目的合作和管理模式，指出这是一种在中国社会转型期培养社会急需的外语和商务复合型人才的有效教育模式。

该项目美方教师的选派由项目美方负责人全面负责，其挑选教师的方式是：在美国各大学招聘和面试教师，这是该项目的一大优势。经过中美办学双方十年的努力，已建立起一支实力强大、相对稳定的外教队伍，这只队伍中83% 为美国在职商科教授或副教授，他们以来自纽约市立大学下属各学院的教授为主体：纽约市立大学皇后学院、纽约市立大学研究生院、纽约市立大学Baruch商学院、纽约市立大学Hunter 学院、纽约市立大学Staten Island学院；还有多个来自美国其他大学：纽约大学Stern School of Business、佛罗里达Rollins大学、俄亥俄州Otterbein 大学。在13名来本专业教授课程的教师中，8名教师多次来我院授课，有的达10次之多。他们认同合作项目的管理模式，学生的好学和配合也使他们感到教有成效。外教们不仅具有一流的教育和学术背景，并能以生动活泼的授课方式启发和开导学生，很受学生欢迎。在每学期组织学生对外教评教活动中，95%外教的最后得分都在85分以上（评估表共20项，每项5分，满分100），对于低于85分的外教，我方通知美方不再聘用。美国纽约市立大学研究生院经济学学位点负责人THOM THURSTON教授和美国纽约市立大学Baruch学院Moshe Banai教授被上海理工大学校长聘为上海－纽约国际联合语言学院名誉教授；佛罗里达Rollins大学中国问题研究中心、Petters项目主任Ilan Alon副教授、美国纽约市立大学Hunter学院的资深教师Mark L. Weinstock被我院聘为SIFE团队指导教师。